研发和建造风暴战机就成为最重要的任务，普通战机是怎么都大不了隐形飞船的。
敌人隐形飞船的守备并不强大，动用2线主力就可以搞定。最重要的是，此飞船上还有一个发着紫光的球体。
击落并抓住敌人Ethereal【异能大师】后就可以开始建造设施并发掘我方异能士兵。注：其实在攻占外星人基地后，如果已经擒获脑残指挥官，就可以开始异能方面的研究。
最后任务，激活球体，并护送激活球体的士兵到敌人母舰的剑桥。
此战就是最后一战，跟原版并没有大的区别，用你在扩展版里得到的所有物质和精神力量去完成拯救地球的使命吧。
到此主线剧情结束。