黑相集棉兰号没有固定结局，根据玩家在游戏中的选择，游戏将会有多种结局，因此角色结局也是不尽相同。在完美结局里，所有队友全部存活，逃离了幽灵船。在最坏结局里，所有角色因为玩家的操作、选择而死亡，游戏提前结束。