只狼中，在仙峰寺的树下玩家可以遇到一个名为小太郎的人，在他身上有一段支线剧情，下面就给大家介绍下小太郎支线剧情的流程。
根据与小太郎的对话可知小太郎曾经是守护皇子们的太郎兵之一，但是却被丢下了。同时需要找一朵洁白的花，花在前往铠甲武士的路上可以拾到。交给小太郎后可以用神隐将小太郎送往幻廊。在幻廊的小太郎和变若子一样能见到死去的皇子们，并送给狼太郎柿。
如果选择给他红白色的风车的话就可以诱导小太郎前往地牢(前提是要触发道顺的任务)，会被拿去做实验变成赤眼的敌人。在地牢里可以捡到腐朽囚徒的手记，里边的囚徒在向小太郎道歉。
在只狼中，玩家是一个名誉不再、伤痕累累的忍者，一个从死亡边缘捡回一命的战士。为了守护效忠的御子，作为忍者战士“狼”于战场、山涧、寺庙等不同场景与不同类型的敌人作战，包括同恶鬼、怪物等非人类的生物以及民间信仰生物展开殊死战斗。